Biserica a fost construită în târgul Cerneți de către ctitorii Ioan Grecescu fost mare polcovnic, Ștefan Miculescu fost mare clucer za arie și jupân kir Ioaniță/Ianoș Armeanu, 1794 septembrie 30, la mijlocul distanței dintre bisericile Sf. Treime și Sf. Nicolae.
Prin osteneala actualului Preot Paroh Corcoveanu Stelian, s-a derulat pe Fonduri Europene proiectul „Consolidare, Restaurare și valorificare Turistică. Biserica Sf. Ioan Botezătorul, sat Cerneți, comuna Șimian”, finanțat prin programul PNDR 2016-2020, având ca scop restaurarea bisericii și includerea ei într-un circuit turistic pentru a putea fi cunoscută și vizitată.